怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?比如有序列:>gi| testKHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCGGGLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH>gi| testMHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/30 02:36:08
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怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?
比如有序列:
>gi| test
KHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
>gi| test
MHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
NHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
我想一次处理一条,应该怎么写?

怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?比如有序列:>gi| testKHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCGGGLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH>gi| testMHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
你指的每个序列都是以>gi| test开头的么?
那可以按行读进来,判断该行是否是>gi| test,如果是,接下来的每一行都单独处理,直到读到下一个>gi| test为止.

怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理?比如有序列:>gi| testKHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCGGGLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH>gi| testMHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 求一段perl分割fasta中DNA序列的代码 fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,求一段perl分割fasta中DNA序列的代码fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,序列,注释,序列放置,分割后,在指定目 看到你的百度知道,有个问题希望能帮我一把,写一段perl.在文件中的提取名称:.在这样的文件中,把“ABC”前面的名称“123”和“234”提取到一个新文件中,“345”不用提取到新文件中. 大家谁知道怎样用perl解决生物问题 perl 中的my (@list) = perl $@ 怎样用RAR把文件的体积压缩变小 perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息. 用perl查一个词表中的词在另一个文档中出现的,频率,输出频率表,并列出该词出现的索引行.我现在有一个词表文件,里面有十几个词,还有一篇已经分好行的一句一句的文章,要用perl写个程序算 有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!有两个fastaq格式的DNA序列文件,想同时把每个文件中每组断片的两端精度小于10的基因删除,之后再将每组平均精度低于30的断片删除,想写一 perl语言中如何表示一个列表中的元素个数 Perl中的默认变量@_和$_什么意思? 应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?我是MEGA软件初级使用者,现在想建一个目的基因的系统进化树,想请教大家在建树时要将同 从文件中提取符合要求的数据,编程语言不限,最好是perl/python/shell/vb/c其中的一种,采纳后另附送30分有一文件,其格式为:共3列,第1列是方位(north,west...),第2列是坐标,第3列是判定条件(共4个 如何用perl读入一个文件,计算文件中各个单词的出现频率,再输出用perl读入一个文件shizegengo.txt,计算文件中各个单词的出现频率,然后再按左边-单词,右边-出现次数perl -w# frequency%count;open TERM, 把汉语中的数字转换为阿拉伯数字谁能用perl编一段程序,将汉语中的数字(简体)转换为阿拉伯数字,像一百二十八->128,或提供一个思想. 简并引物 设计软件有Fasta格式的比对文件想设计简并引物该用什么软件? 用perl处理下面格式内容,把中间的大写字母的固定数值的配对率测出来,根据中间配对率大小:把等于0.8的存入文件1.txt.I001 195 TTGGT 205 225E012 148 TTCGT 158 200I001 1124 TTTCTT 1151 2978E012 4 TAATGT 31 128I002