大家谁知道怎样用perl解决生物问题

来源：学生作业帮助网编辑：作业帮时间：2024/04/29 19:03:01

大家谁知道怎样用perl解决生物问题
大家谁知道怎样用perl解决生物问题

大家谁知道怎样用perl解决生物问题
Perl 是一种自由且功能强大的编程语言.它被用作 Web 编程、数据库处理、XML 处理以及系统管理等等.
Perl在生物方面的应用主要集中于生物信息学中的基因/蛋白序列分析上.它既善于文本分析,在遗传算法上也有优异表现.现在已经出现了以Perl的模块和脚本为基础开发的生物信息工具Bioperl.
Bioperl的优点主要有三.首先,Perl操作简单,在扭转,切割,总结文字方面十分优秀,而生物信息如物种属名称,DNA蛋白质序列及其注释等都是文字或类文字.
第二,Perl能容错.生物资料多是不完全的,Perl在对资料的处理上有很好的弹性.
第三.Perl是组件导向的语言.人们可以利用Perl各自开发编写程序,然后进行交流和组合,从而使智慧成果得到聚集.
此外,Perl是很好的原型语言,且在网页制作方面有突出表现.
但是Perl在生物信息学中的应用也有其不足.比如很少有人用perl写一个BLAST,因为太慢了.并且,Perl在建立大型平台方面没有优势.对于Bioperl的应用,扬长避短才是正道.
以上
PS 《Beginning Perl for Bioinformatics》是很流行的一本书,感兴趣的化可以看看.

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